Frombork jest miastem nad Zalewem Wiślanym, który to jest zbiornikiem słonej wody, oddzielony jest od Morza bałtyckiego Mierzeją Wiślaną. W czternastym wieku z powodu braku bieżącej wody przekopano tutaj prawie pięciokilometrowy kanał, biegnący po części przez Frombork.